Хана и Алиса: Дело об убийстве

Четырнадцатилетняя Тэцуко Арисугава, известная как Алиса, переезжает с матерью из столицы в провинциальный город после развода родителей. Она переводится в новую среднюю школу, где соседи проявляют необычный интерес к процессу переезда, наблюдая за ним из окон. В школе Алиса сталкивается с игнорированием со стороны одноклассников. Позже она узнает, что ей досталась парта ученика по имени Иуда, который, по слухам, был убит год назад. Таинственный наблюдатель, живущий напротив, оказывается девочкой по имени Хана Араи, которая не посещает школу и следит за Алисой из окна.

Алиса пытается выяснить, как связаны загадочное убийство Иуды и поведение Ханы. События развиваются вокруг расследования этой связи, а также причин, по которым Хана избегает общества и проявляет интерес к новой соседке. Сюжет основан на предыстории полнометражного фильма 2004 года «Хана и Алиса», раскрывая обстоятельства, предшествовавшие событиям оригинальной картины.