Югио! Тёмная сторона измерений

Сето Каиба, одержимый желанием отомстить Королю Игр, начинает раскопки в Египте с целью найти фрагменты Головоломки Тысячелетия, в которой ранее обитал дух «другого Юги». Однако фигура в плаще похищает две части Головоломки и исчезает до того, как её удаётся восстановить. Тем временем Юги Муто и его друзья, находясь на последнем году старшей школы, строят планы на будущее, не подозревая о приближающейся угрозе.

Сюжет фильма «Югио! Тёмная сторона измерений» разворачивается вокруг того, как мстительные силы искажают реальность по своему усмотрению. Сето и Юги сталкиваются с необходимостью преодолеть разногласия ради спасения мира, однако личная жадность Каибы может помешать этому.